《菌物学报》主要刊登我国菌物学（包括真菌、粘菌、卵菌）研究领域在理论上和实践上的最新研究成果。报道内容包括菌物多样性、系统分类学、起源与进化、菌物区系地理学、生态学、遗传学、生理学、生物化学、濒危菌物物种保护生物学以及食药用真菌、有毒真菌、真菌毒素、人类病原真菌、植物病原真菌、兽医真菌、互惠共生菌物等方面的研究论文、简报和综述。
菌物学报荣誉2012年、2013年、2015年—2017年，期刊五次被评为“中国国际影响力优秀学术期刊”。
2017年，学报入选“第四届精品科技期刊”。
菌物学报栏目设有菌物系统分类学及菌物多样性、菌物资源开发利用、真菌生态及生物防治、菌物共生作用、真菌毒素、致病真菌、菌物学研究的新方法、新技术等栏目。
《菌物学报》投稿须知
1. 本刊要求研究论文必须有创新性，内容充实完整；研究简报着重要求创新性；文献综述应由该领域内知名专家结合本人近年研究成果完成，要求有较强的前瞻性和指导性。
2. 我刊严禁一稿多投，重复内容多次投稿（包括将以不同文种分别投稿）以及抄袭他人论文等现象。一旦发现有上述情况，该作者的稿件将被作退稿处理，同时通知所在单位严肃处理，并相关领域兄弟期刊通报。我刊将拒绝发表通讯作者作为主要作者的所有投稿。
3. 上传电子稿件应为WORD（*.doc）文档。文稿务求论点明确、文字精练、数据可靠。在正文前，各加7个以内"关键词"和400字左右的"摘要"，且关键词不与文章题目重复。参考文献20条以上，要能反映该学科近年来的发展情况。
4. 稿件审查结果一般在1～2月之内通知作者，有个别稿件可能送审时间较长，如果超过3个月后仍未接到审稿结果，作者可与编辑部取得联系后自投它处。
5. 稿件的作者必须是直接参与研究工作或对其有重要指导作用的成员（如研究生导师等），协助做实验的人员可放入致谢中。作者人数请控制在6人以下，严禁与论文无关人员挂名。
6. 通过审查后需要修改和补充实验的稿件，最晚不超过1个月将修改稿返回编辑部，如有困难需及时向编辑部说明情况，3个月不返回修改稿件，按作者自动撤稿处理。
7. 稿件作者及单位一经投稿，不再变更；一经发表，不做更正。投稿前请作者认真核对。
8. 本刊对新种文章将予以优先发表。
9. 关于测序类文章：凡涉及DNA、RNA或蛋白质序列测定的论文，投稿前请先通过计算机网络进入国家微生物科学数据中心NMDC（http://nmdc.cn/）或国际基因库EMBL（欧洲）、GenBank（美国）或DDBJ（日本），申请得到接受号（Accession No.）后再进行投稿。（国家微生物科学数据中心支撑科学家发表文章时的数据存储、共享，支持微生物样本、菌株、核酸序列、微生物基因组、微生物元基因组、转录组、蛋白质结构、期刊附件等多种类型数据提交。数据提交后3个工作日内完成审核并发放编号，且为每条数据提供DOI。点击http://nmdc.cn/submit/dashboard直达数据提交页面）。
10. 动物实验伦理要求：涉及动物实验的来稿，需要遵守实验动物福利与伦理相关规定，并获得伦理委员会批准。文中需注明伦理委员会的具体名称及批准文号，并将批准文件的电子版提交编辑部。
投稿写作格式注意事项：
1. 在投稿前，确保投稿格式与本刊最新的已发表文章格式一致（页眉格式除外，可单栏排版）。本刊只受理严格符合本刊已发表文章格式的投稿。您可在本刊网站首页【下载专区】中获得投稿模板进行参照。
2. 英文写作要规范：要求来稿英文题目准确无误，英文摘要和英文图注和表注尽量详细，尽量做到国外同行在看不懂中文内容的情况下，可以从英文摘要和图注、表注中获得必要的信息。
3. 参考文献引列方式：文中参考文献采用“著者-出版年”制。在论文中标注的格式：例 文献为一位作者：戴芳澜 （1979）或 （戴芳澜 1979）；两位作者：（Arthur & Cummins 1936），（庄剑云和魏淑霞 1994）；三位作者（含）以上：戴玉成等（2007）或（戴玉成等 2007），（Smith et al. 1981）。文末参考文献中文按照汉语拼音字母顺序排列，西文按姓氏字母顺序排列，作者必须全部列出（超过20位作者时只保留3位）。
4. 图片和表格随文排，先文字后图表，图和表不要放在文章的最后，文章全部图片的可编辑文件请单独以附件的形式上传。
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