《蛋白质组学杂志》面向蛋白质组学、生物标志物发现、蛋白质分析、植物蛋白质组学、微生物和动物蛋白质组学、人体研究、质谱组织成像、非常规和非模型生物蛋白质组学、蛋白质生物信息学等领域的蛋白质科学家和分析化学家。该杂志欢迎在代谢组学、基因组学、系统生物学、毒物基因组学、药物蛋白质组学等新领域和即将发表的论文。蛋白质组学杂志结合了基础科学家和临床医生，包括翻译研究。欢迎就检讨、网上研讨会及专题问题提出建议。所有稿件均经过严格的同行评审，并符合最高的道德标准。《蛋白质组学杂志》是欧洲蛋白质组学协会(EuPA)的官方期刊，同时出版EuPA官方报告，并与HUPO等合作伙伴共同参与国际蛋白质组学教程项目。
| 大类学科 | 分区 | 小类学科 | 分区 | Top期刊 | 综述期刊 |
| 生物学 | 2区 | BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS 生化研究方法 | 2区 | 否 | 否 |
| JCR分区等级 | JCR所属学科 | 分区 | 影响因子 |
| Q2 | BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS | Q2 | 3.855 |
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