《蛋白质与肽通讯》出版蛋白质与肽研究的所有重要方面的信件、原始研究论文、小型评论和客座编辑的问题，包括结构研究、重组表达、功能、合成、酶学、免疫学、分子模型和药物设计的进展。稿件必须具有显著的新颖性、及时性和紧迫性，值得迅速出版。有关生物重要蛋白的结晶和初步结构测定的报告，只有在它们包括重要的新方法或处理直接重要的蛋白，以及生物重要蛋白的初步结构测定时，才予以考虑。纯理论/综述性论文应该为蛋白质/肽结构和功能的原理提供新的见解。描述计算工作的手稿应包括一些实验数据，以证实计算结果。
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